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保姆级思路带你开展免疫浸润,巧拿5分+!
来源:个人图书馆-科研小料君     时间:2023-08-26 17:25:12

今天给大家介绍的一篇文章题目为“ITGAL as a Prognostic Biomarker Correlated With Immune Infiltrates in Gastric Cancer”(ITGAL作为与胃癌免疫浸润相关的预后生物标志物的研究)。


【资料图】

引言

整合素αL(ITGAL)是整合素家族的一员,其异常表达与肿瘤发生和免疫调节有关。然而,ITGAL与胃癌(GC)和肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)预后的关系尚不清楚。

研究方法

图一

图一:整合素αL(ITGAL)在不同类型人类肿瘤中的表达水平。

(A)通过肿瘤免疫估计资源(TIMER)确定来自癌症基因组图谱(TCGA)数据库的不同肿瘤类型中ITGAL 的增加或减少。

(B)在基因表达谱相互作用分析(GEPIA)中,与正常组织相比,胃癌组织中ITGAL增加。

(C)与来自TCGA数据库的匹配的正常组织相比,胃癌中ITGAL表达增加(n=27)。

(D)10对GC组织其配对的正常相邻组织中ITGAL的mRNA水平。

(E)利用西方墨点法检测10对GC组织及其配对的相邻正常组织中的蛋白质水平。

(F)ITGAL与PD1mRNA水平的相关性分析。

(G)胃癌(GC)患者ITGAL的受试者操作特征(ROC)曲线分析。

图二

图二:UALCAN数据库研究胃癌ITGAL mRNA表达水平与临床病理参数的相关性。

(A)样本类型(正常/原发肿瘤)。

(B)癌症阶段。

(C)淋巴结分期(N01,2和3)。

(D)胃癌亚组。

图三

图三:Kaplan-Meier生存曲线比较卡普兰-Meier绘图数据库中ITGAL在胃癌中的高表达和低表达。

(A)胃癌队列OS,PPS和FP的生存曲线(213475-s-at)。

(B)胃癌的OS,PPS和FP存活曲线(1554240-a-at)。

图四

图四:胃癌组织中ITGAL的表达与免疫浸润的关系。

(A)TISIDB数据库中ITGAL的表达与TILsin胃癌丰度之间的相关性。

(B)在TIMER2.0数据库中可获得的胃癌中ITGAL 表达与CD8+T细胞,CD4+T细胞,Treg细胞,B 细胞,嗜中性粒细胞,巨噬细胞,骨髓树突状细胞,自然杀伤细胞和单核细胞浸润水平的相关性。

图五

图五:ITGAL在胃腺癌组织中的表达与单核细胞、巨噬细胞和T细胞耗竭相关。

ITGAL表达与单核细胞(A),TAM(B)和M1(C),M2巨噬细胞(D)和T细胞耗竭(E)的基因标志物之间的相关性散点图。

结论

ITGAL表达上调与GC中CD8+T细胞,C4+T细胞,巨噬细胞,嗜中性粒细胞和髓样树突状细胞的预后不良和免疫浸润程度增强密切相关。此外,ITGAL的表达有助于调节M2巨噬细胞、Treg和T细胞耗竭。因此,本研究提示ITGAL可能作为一种预后生物标志物,在调节GC患者免疫细胞浸润方面具有新的潜在功能。

参考文献:Barber, D. F., Faure, M.,and Long, E. O. (2004).

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